O Programa de Pós-Graduação em Ciência do Solo recebe anualmente recursos para manutenção das atividades. A principal fonte de recursos para manutenção são os recursos disponibilizados pela CAPES através do Programa PROAP (Programa de Apoio à Pós-Graduação).
Além disso, o Curso tem aporte direto da UDESC para a manutenção do acervo bibliográfico.
Indiretamente, a UDESC disponibiliza recursos de manutenção para o Departamento de Solos e Recursos Naturais, cuja aplicação beneficia as atividades do Curso de Ciência do Solo.
Outro progama institucional importante é o PAP (Programa de Apoio a Pesquisa), que financia diretamente as atividades dos grupos de pesquisa, beneficiando os Grupos de Pesquisa cadastrados na Plataforma Grupos do CNPQ.
Financiamentos individuais a pesquisadores por agências de fomento nacionais e estaduais, como CNPq e FAPESC, aportam recursos diretamente aos projetos de pesquisa, dando suporte às pesquisas desenvolvidas. Também projetos envolvendo grupos de pesquisadores e/ou cursos também são fontes para investimentos em infraestrutura e equipamentos, onde agências como FINEP CAPES, FAPESC e a UDESC disponibilizam recursos para investimentos em material permanente.
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