Nesta sala podemos encontrar a reconstrução das antigas salas de ciências, presentes nas escolas. Apresenta Atlas de Anatomia Humana, Pôsteres e Mapas de Anatomia, objetos de laboratórios de ciências, bonecos do corpo humano para montar e outros materiais pertinentes.

As aulas de Ciências tinham e têm como objetivo tornar a educação científica mais próxima dos estudantes nas áreas de Ciências da Natureza de maneira interdisciplinar, lúdica e interativa, reconhecendo seu potencial científico-tecnológico na sociedade.

No Museu da Escola Catarinense, apresentam-se em destaque objetos que pertenceram e foram utilizados na antiga Escola Básica Lauro Muller, de Florianópolis, os quais foram doados ao MESC no ano de 2022.