Complexidade genômica, desvios de composição nucleotídica, transições e transversões. Implicações nas
análises comparativas, organização e evolução de genomas animais, padrões ótimos e não-ótimos de códon-usage e suas
implicações. Evolução de genes codificadores de proteínas e de sequências não codificadoras, evolução de famílias
gênicas, evolução de introns e transposons e implicações filogenéticas. Transferência horizontal, pseudogeneses e "DNA
lixo". Processos de evolução genômica e de diversificação de genes e fenótipos. Alinhamento de sequências: conceitos e
problemas. Homologia X Homoplasia na análise da biodiversidade molecular. Relógio molecular e filogenias
moleculares.